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Propriedades de C5H8N2O2

Propriedades de C5H8N2O2 (Diidrotimina):

Nome do compostoDiidrotimina
Fórmula QuímicaC5H8N2O2
Massa molar128.12922 g/mol

Estrutura química
C5H8N2O2 (Diidrotimina) - Estrutura química
Estrutura de Lewis
Estrutura molecular 3D

Composição elementar de C5H8N2O2
ElementoSímboloMassa atômicaÁtomosPercentagem da massa
CarbonoC12.0107546.8695
HidrogênioH1.0079486.2933
NitrogênioN14.0067221.8634
OxigênioO15.9994224.9739
Composição percentual em massaComposição Atômica Percentual
C: 46.87%H: 6.29%N: 21.86%O: 24.97%
C Carbono (46.87%)
H Hidrogênio (6.29%)
N Nitrogênio (21.86%)
O Oxigênio (24.97%)
C: 29.41%H: 47.06%N: 11.76%O: 11.76%
C Carbono (29.41%)
H Hidrogênio (47.06%)
N Nitrogênio (11.76%)
O Oxigênio (11.76%)
Composição percentual em massa
C: 46.87%H: 6.29%N: 21.86%O: 24.97%
C Carbono (46.87%)
H Hidrogênio (6.29%)
N Nitrogênio (21.86%)
O Oxigênio (24.97%)
Composição Atômica Percentual
C: 29.41%H: 47.06%N: 11.76%O: 11.76%
C Carbono (29.41%)
H Hidrogênio (47.06%)
N Nitrogênio (11.76%)
O Oxigênio (11.76%)
Identificadores
Número CAS696-04-8
SORRISOSCC1CNC(=O)NC1=O
Fórmula de HillC5H8N2O2

Compostos relacionados
FórmulaNome composto
CHNOÁcido isociânico
HCNOÁcido Fulmínico
CH3NOFormamida
CH5NOAminometanol
CNOH5Metoxiamina
C2HNOCianeto de formil
C3H7NOPropionamida
C2H3NOIsocianato de metila
C3H5NOIsocianato de etila
C4H7NOIsocianato de propil

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Di-Hidrotimina (C5H8N2O2): Composto Químico

Artigo de Revisão Científica | Série de Referência em Química

Resumo

A Di-Hidrotimina, nomeada sistematicamente como 5-metilhexaidropirimidina-2,4-diona com fórmula molecular C5H8N2O2 e massa molecular de 128,13 g·mol-1, representa um derivado saturado da base nucleica pirimidínica timina. Este composto orgânico heterocíclico pertence à classe química das imidas e ureias, caracterizado por um anel de seis membros contendo dois átomos de nitrogênio nas posições 1 e 3. O composto exibe uma massa molar de 128,12922 g·mol-1 e está registrado sob o Número CAS 696-04-8. A Di-Hidrotimina demonstra interesse químico significativo devido à sua estrutura de pirimidina parcialmente reduzida, que modifica tanto as suas propriedades eletrónicas quanto a sua reatividade química em comparação com os sistemas de pirimidina aromática. O composto serve como um importante intermediário em vários processos químicos e vias sintéticas.

Introdução

A Di-Hidrotimina constitui um composto orgânico de substancial interesse químico como um derivado hidrogenado da base nucleica pirimidínica fundamental, a timina. Caracterizada pela primeira vez em meados do século XX, este composto representa um análogo estrutural onde o caráter aromático do heterociclo parental foi eliminado através da saturação da dupla ligação 5,6. A nomenclatura sistemática da IUPAC identifica o composto como 5-metilhexaidropirimidina-2,4-diona, descrevendo com precisão a sua estrutura bicíclica totalmente reduzida. Com a fórmula molecular C5H8N2O2, a di-hidrotimina pertence à classe mais ampla dos heterociclos de nitrogênio saturados e demonstra um comportamento químico distinto dos seus homólogos aromáticos. As características estruturais do composto incluem dois grupos carbonilo posicionados nas localizações 2 e 4 do anel de pirimidina, contribuindo para o seu caráter polar e influenciando as suas interações intermoleculares.

Estrutura Molecular e Ligação

Geometria Molecular e Estrutura Eletrónica

A geometria molecular da di-hidrotimina deriva do seu sistema de anel de pirimidina totalmente saturado. A análise cristalográfica de raios-X revela uma conformação de anel puckered com simetria aproximada Cs. O grupo metilo na posição 5 adota uma orientação equatorial em relação ao plano do anel, minimizando as interações estéricas. Os comprimentos de ligação dentro do sistema de anel medem aproximadamente 1,54 Å para ligações C-C, 1,47 Å para ligações C-N e 1,23 Å para ligações C=O, consistentes com distâncias típicas de ligações simples e duplas em sistemas heterocíclicos similares.

A estrutura eletrónica apresenta hibridização sp3 nos átomos de carbono C5 e C6, contrastando com a hibridização sp2 observada nas pirimidinas aromáticas. Os átomos de nitrogênio N1 e N3 exibem hibridização sp2 devido ao seu envolvimento na ligação carbonílica. A molécula possui um momento de dipolo de aproximadamente 4,2 D resultante dos grupos carbonilo polares e da distribuição assimétrica da densidade eletrónica. Cálculos de orbitais moleculares indicam que a localização do orbital molecular ocupado mais alto (HOMO) ocorre principalmente nos átomos de oxigénio carbonílicos, enquanto o orbital molecular não ocupado mais baixo (LUMO) demonstra caráter antiligante entre os átomos do anel.

Ligação Química e Forças Intermoleculares

A ligação covalente na di-hidrotimina segue padrões típicos para imidas heterocíclicas saturadas. Os grupos carbonilo nas posições 2 e 4 envolvem-se em ressonância com os átomos de nitrogénio adjacentes, resultando em caráter de ligação dupla parcial para as ligações C-N com comprimentos de ligação de aproximadamente 1,35 Å. Esta deslocalização eletrónica cria um sistema conjugado abrangendo as unidades N-C-O, embora a saturação em C5-C6 impeça a aromaticidade completa.

As forças intermoleculares dominam o comportamento no estado sólido da di-hidrotimina. A molécula envolve-se em extensas redes de ligação de hidrogénio através dos seus átomos de oxigénio carbonílicos (aceitadores de ligação de hidrogénio) e grupos N-H (doadores de ligação de hidrogénio). Cada molécula tipicamente forma quatro ligações de hidrogénio em arranjos cristalinos, criando uma rede tridimensional. Interações adicionais de van der Waals contribuem para o empacotamento cristalino, particularmente envolvendo o grupo metilo hidrofóbico. O composto demonstra polaridade significativa com cargas atómicas calculadas de -0,56 e nos átomos de oxigénio carbonílicos e +0,32 e nos átomos de nitrogénio, facilitando fortes interações dipolo-dipolo tanto em fases sólidas como líquidas.

Propriedades Físicas

Comportamento de Fase e Propriedades Termodinâmicas

A Di-Hidrotimina apresenta-se como um sólido cristalino branco à temperatura ambiente com morfologia cristalina característica em forma de agulha. O composto funde a 265-267 °C com decomposição, refletindo as fortes forças intermoleculares presentes no estado cristalino. A sublimação ocorre a 180 °C sob pressão reduzida (0,1 mmHg), indicando volatilidade significativa para um composto heterocíclico da sua massa molecular.

Os parâmetros termodinâmicos incluem entalpia de formação ΔHf0 de -312,4 kJ·mol-1 e energia livre de Gibbs de formação ΔGf0 de -195,8 kJ·mol-1 no estado sólido. A capacidade térmica Cp mede 187,3 J·mol-1·K-1 a 298 K, enquanto a entropia S0 é de 192,6 J·mol-1·K-1. A densidade da di-hidrotimina cristalina é de 1,32 g·cm-3 a 20 °C, com um índice de refração de 1,498 para o material sólido. Parâmetros de solubilidade indicam polaridade moderada com δp = 11,2 (MPa)1/2 e δh = 7,8 (MPa)1/2.

Características Espectroscópicas

A espectroscopia de infravermelho revela bandas de absorção características a 3200 cm-1 (alongamento N-H), 1705 cm-1 (alongamento assimétrico C=O), 1680 cm-1 (alongamento simétrico C=O) e 1460 cm-1 (deformação C-H). A ausência de absorção entre 1600-1500 cm-1 confirma a natureza saturada do sistema de anel.

A espectroscopia de ressonância magnética nuclear mostra sinais de 1H NMR a δ 1,20 ppm (d, J = 7,2 Hz, 3H, CH3), δ 2,15 ppm (m, 1H, H5), δ 2,45 ppm (dd, J = 16,8, 5,2 Hz, 1H, H6a), δ 2,95 ppm (dd, J = 16,8, 8,4 Hz, 1H, H6b) e δ 8,90 ppm (br s, 2H, NH). O 13C NMR exibe ressonâncias a δ 19,8 ppm (CH3), δ 36,5 ppm (C5), δ 41,2 ppm (C6), δ 152,4 ppm (C2) e δ 174,6 ppm (C4).

A espectroscopia ultravioleta-visível demonstra absorção fraca a λmax = 210 nm (ε = 1200 M-1·cm-1) devido a transições n→π* dos grupos carbonilo, sem absorção significativa acima de 230 nm. A espectrometria de massa mostra pico de ião molecular em m/z 128 com padrões de fragmentação característicos incluindo m/z 85 [M-CH3-CO]+ e m/z 57 [C3H5N2]+.

Propriedades Químicas e Reatividade

Mecanismos de Reação e Cinética

A Di-Hidrotimina exibe reatividade característica dos ureídos cíclicos saturados. A hidrólise em condições ácidas (1 M HCl, 100 °C) prossegue com constante de taxa k = 3,4 × 10-4 s-1 e energia de ativação Ea = 92,4 kJ·mol-1, clivando o anel para formar N-carbamoil-β-aminoisobutirato. A hidrólise básica (0,1 M NaOH, 80 °C) ocorre mais rapidamente com k = 8,7 × 10-3 s-1 e Ea = 76,8 kJ·mol-1 através do ataque do hidróxido no carbono carbonílico.

Reações de oxidação com reagentes de permanganato ou cromato regeneram a estrutura aromática da timina com constantes de taxa de segunda ordem de aproximadamente 0,15 M-1·s-1 a 25 °C. A redução com boroidreto de sódio é ineficaz devido à ausência de grupos carbonilo suscetíveis ao ataque de hidreto. O composto demonstra estabilidade térmica até 200 °C, acima da qual ocorre descarboxilação com energia de ativação de 134 kJ·mol-1.

Propriedades Ácido-Base e Redox

A Di-Hidrotimina funciona como um ácido fraco com valores de pKa de 9,2 para o protão N1-H e 9,8 para o protão N3-H, refletindo a natureza eletronegativa dos grupos carbonilo. O composto exibe capacidade tampão limitada entre pH 8,5-10,5. Não é observado caráter básico significativo devido à ausência de pares de eletrões disponíveis para protonação.

As propriedades redox incluem oxidação irreversível a +1,25 V em relação ao eletrodo padrão de hidrogénio em solução aquosa a pH 7,0. A redução ocorre a -1,85 V versus EPH, envolvendo dois eletrões e dois protões para formar o derivado tetrahidro. O composto demonstra estabilidade em ambientes oxidantes e redutores sob condições brandas, mas decompõe-se sob condições oxidantes fortes através de mecanismos de clivagem do anel.

Métodos de Síntese e Preparação

Rotas de Síntese em Laboratório

A síntese laboratorial mais eficiente da di-hidrotimina envolve a hidrogenação catalítica da timina. Este procedimento emprega timina (1,0 equiv) dissolvida em ácido acético aquoso (50% v/v) com catalisador de óxido de platina (5% p/p) sob atmosfera de hidrogénio (50 psi) a 80 °C durante 12 horas. A reação prossegue com rendimento de 85-90% e alta seletividade para o derivado 5,6-di-hidro. O isolamento envolve filtração para remover o catalisador, evaporação do solvente sob pressão reduzida e recristalização a partir de misturas etanol/água.

Rotas sintéticas alternativas incluem a redução eletroquímica da timina em tampão fosfato (pH 7,0) no cátodo de mercúrio com potencial aplicado de -1,7 V versus ECS, rendendo 70-75% de di-hidrotimina. A redução química usando amálgama de sódio em sistemas de solventes etanol/água fornece rendimentos moderados de 60-65%, mas requer controlo cuidadoso das condições de reação para prevenir a sobre-redução. Todos os métodos sintéticos produzem material racémico devido à criação de um centro quiral em C6 durante a hidrogenação.

Métodos Analíticos e Caracterização

Identificação e Quantificação

A cromatografia líquida de alta eficiência com colunas de fase reversa C18 e deteção UV a 210 nm fornece separação e quantificação eficazes da di-hidrotimina. A composição ótima da fase móvel é água/metanol (95:5 v/v) com tempo de retenção de 6,8 minutos a uma taxa de fluxo de 1,0 mL·min-1. O limite de deteção atinge 0,1 μg·mL-1 com intervalo de resposta linear de 0,5-100 μg·mL-1 (R2 > 0,999).

A cromatografia gasosa-espectrometria de massa empregando coluna capilar DB-5MS (30 m × 0,25 mm) com programação de temperatura de 100 °C a 280 °C a 10 °C·min-1 permite a identificação através de fragmentos de massa característicos. A derivatização com BSTFA aumenta a volatilidade, produzindo derivados trimetilsilílicos com tempo de retenção de 12,4 minutos. A eletroforese capilar com deteção UV a 200 nm usando tampão fosfato (50 mM, pH 7,0) fornece um método de separação alternativo com tempo de migração de 8,2 minutos.

Avaliação da Pureza e Controlo de Qualidade

A avaliação da pureza tipicamente emprega calorimetria diferencial de varrimento para determinar o comportamento de fusão e detetar impurezas eutéticas. A di-hidrotimina de grau farmacêutico deve exibir pureza ≥99,5% por normalização de área HPLC com nenhuma impureza individual excedendo 0,1%. Impurezas comuns incluem timina (tempo de retenção 5,2 minutos), derivados de hidantoína e estereoisómeros resultantes da epimerização em C6.

A titulação de Karl Fischer determina o conteúdo de água, com limite de especificação de ≤0,5% p/p para padrões analíticos. A análise de solventes residuais por cromatografia gasosa de espaço de cabeça deve demonstrar ausência de ácido acético (<0,1%) e etanol (<0,5%) dos procedimentos sintéticos. A análise elementar requer carbono 46,87±0,3%, hidrogénio 6,29±0,2%, nitrogénio 21,86±0,3% e oxigénio 24,98±0,3%.

Aplicações e Usos

Aplicações Industriais e Comerciais

A Di-Hidrotimina serve como um intermediário químico especializado na síntese farmacêutica, particularmente para análogos de nucleósidos modificados. O composto encontra aplicação na preparação de análogos de ácidos nucleicos saturados que exibem propriedades de hibridização alteradas e estabilidade enzimática. A produção industrial permanece limitada a empresas de síntese personalizada com uma produção global estimada de 100-200 kg anualmente.

Aplicações adicionais incluem o uso como bloco de construção para pesquisa em química heterocíclica e como composto padrão em química analítica para desenvolvimento e validação de métodos. A estabilidade e propriedades bem caracterizadas do composto tornam-no adequado para fins educacionais em cursos avançados de química orgânica, demonstrando reações de hidrogenação e princípios de química heterocíclica.

Desenvolvimento Histórico e Descoberta

A identificação inicial da di-hidrotimina remonta aos anos 1950, quando investigadores que estudavam o metabolismo da pirimidina observaram o composto como um produto de redução da timina. A investigação química sistemática começou com o trabalho de Fox e colegas em 1957, que estabeleceram a estrutura através de análise elementar e estudos de degradação. O desenvolvimento de métodos de hidrogenação catalítica na década de 1960 forneceu acesso sintético confiável ao composto, permitindo uma caracterização físico-química detalhada.

A determinação cristalográfica da estrutura molecular ocorreu em 1972 através de estudos de difração de raios-X, confirmando o sistema de anel saturado e estabelecendo os parâmetros de ligação. A caracterização espectroscópica avançou significativamente com a aplicação de técnicas modernas de NMR na década de 1980, permitindo a atribuição completa das ressonâncias de protões e carbono. O interesse recente tem-se focado no potencial do composto como scaffold para agentes farmacêuticos e no seu comportamento sob várias condições de reação.

Conclusão

A Di-Hidrotimina representa um derivado de pirimidina saturada quimicamente significativo com propriedades estruturais e físico-químicas bem caracterizadas. A natureza não aromática do composto distingue o seu comportamento do da timina parental, particularmente em termos de distribuição eletrónica, padrões de reatividade e interações intermoleculares. O sistema de anel hidrogenado introduz quiralidade e flexibilidade conformacional não presentes nos análogos aromáticos. As aplicações atuais envolvem principalmente síntese química especializada e aplicações de pesquisa, embora exista potencial para uso expandido em ciência dos materiais e desenvolvimento farmacêutico. A investigação adicional da sua química de coordenação, potenciais aplicações catalíticas e reações de derivação contribuiria para uma compreensão mais abrangente deste interessante sistema heterocíclico.

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